基于高通量测序技术的樱桃根际细菌群落研究

编号 zgly0001639928

文献类型 期刊论文

文献题名 基于高通量测序技术的樱桃根际细菌群落研究

作者 赵柏霞  潘凤荣  韩晓日 

作者单位 沈阳农业大学农业资源与环境博士后流动站  大连市农业科学研究院 

母体文献 土壤通报 

年卷期 2018年03期

年份 2018 

分类号 S154.3 

关键词 砂蜜豆/马哈利  根际细菌  生长发育期  高通量测序 

文摘内容 本研究基于Illumina Hiseq测序平台和16S r DNA扩增测序技术,对三年生砂蜜豆/马哈利樱桃5个生长发育期(萌芽期、展叶期、新梢迅速生长期、新梢停长期及落叶期)根际土壤细菌群落分别进行了基因序列测定,分析了不同生长发育期根际细菌种群结构的变化。结果表明变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、厚壁菌门(Firmicute)以及放线菌门(Actinobacteria)细菌在所有样品中均为优势菌群,检出率高达80%以上。在樱桃生长过程中,不同生长发育期根际细菌群落结构不同,萌芽期种群类别最少,然后逐渐增加,到新稍迅速生长期达最多,多样性最丰富,进而又逐渐减少。对样品序列进行聚类分析,5个样品归属于两大类群,萌芽期、展叶期及新稍迅速生长期的根际土壤样品具有更加相似的细菌群落结构;而停长期和落叶期样品中细菌组成相似。研究还发现绿弯菌门细菌是新稍迅速生长期和其他样品之间具有统计学差异的物种。由此可见,砂蜜豆/马哈利樱桃生长发育期对根际土壤细菌群落具有一定的影响。