山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析

编号 zgly0001438504

文献类型 期刊论文

文献题名 山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析

作者 杨希宏  黄有军  陈芳芳  黄坚钦 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2013年01期

年份 2013 

分类号 S664.1 

关键词 植物学  山核桃  CcFLC  序列分析  表达分析 

文摘内容 根据本课题组对山核桃Carya cathayensis花芽454测序获得的CcFLC基因的2个开放阅读框(ORF)分别设计引物并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,获得开放阅读框大小分别为639 bp和612 bp,编码212个和203个氨基酸,GenBank登录号分别为JQ829074和JQ829075,都具有典型的MADS-box结构域,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78%和67%,5′端高度同源,3′端差异较大。与太行花Taihangia rupestris和梨Pyrus pyrifolia等物种的FLC-like基因的氨基酸序列同源性达到40%~57%。氨基酸疏水性分析显示,它们的羧基端都是疏水性氨基酸,而氨基端是亲水性氨基酸,大部分氨基酸残基是疏水性的。实时定量PCR结果显示:CcFLC基因的2个开放阅读框在山核桃的营养枝的幼茎、幼叶、顶芽,以及短果枝的雌花芽和雄花芽中都有表达,但相对表达量存在较大差异,同一组织中ORF1的表达丰度明显高于ORF2。ORF1表达量在茎中最高,但在叶和雄花芽的表达量最低;ORF2在雌花芽中相对表达量最高,茎中表达量最低。图7参23