小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达

编号 zgly0001670101

文献类型 期刊论文

文献题名 小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达

作者 张月  韩雅婷  胡号东  廖诗贤  周博如 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2019年07期

年份 2019 

分类号 S763.7 

关键词 小黑杨  叶枯病  转录组  高通量测序  差异表达基因 

文摘内容 为揭示小黑杨(Populus simonii×P. nigra)在叶枯病病原菌(Alternaria alternata)胁迫下基因差异表达情况,以叶枯病病原菌接种叶片处理组,以无菌PDA培养基处理为对照组,用Illumina Hi Seq测序平台对来自小黑杨叶片的RNA进行测序。结果表明:共得到551个差异表达基因,对差异表达基因进行功能注释并整理分类,获得112个编码酶类的基因,116个编码蛋白的基因。通过与GO数据库比对,其中38个差异表达基因属于生物过程,有333个差异表达基因属于分子功能,有11个差异表达基因属于细胞组分。通过与KEGG数据库进行比对,获得14条代谢通路。与TFDB数据库比对,发现27个转录因子,属于14个转录因子家族。