肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定

编号 zgly0001645298

文献类型 期刊论文

文献题名 肺形侧耳线粒体基因组多态性鉴定

作者 叶丽云  孟国良  程冰  赵丽丽  解凡  吴小平 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年09期

年份 2018 

分类号 S646 

关键词 野生肺形侧耳  线粒体基因组  多态性  种内鉴定 

文摘内容 线粒体是能量转化与ATP形成的重要场所,已有多种食用真菌的线粒体基因组被相继组装注释,但肺形侧耳的线粒体基因组鲜有报道。本研究对野生肺形侧耳X2菌株的线粒体基因组进行组装并注释,由野生菌株X2与主栽菌株JX线粒体大片段差异序列,构建分子标记来鉴别野生和主栽肺形侧耳菌株。结果显示X2的线粒体基因组为大小75 709bp的闭合环状结构,含有r RNA的大小亚基基因,25个负责携带氨基酸的t RNA基因以及14个常见蛋白编码基因,在cox1基因上含有9个内含子。内含子主要为IB型,包含LAGLIDADG1 superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守结构域。位于菌株X2与JX内含子和基因间区上的大片段差异序列,是造成种内线粒体多态性的主要因素。根据两菌株的差异片段构建系统进化树的结果显示,内含子、rnl-trn X、trn D-atp6序列能够将两株野生菌株和其他主栽菌株区分开,可用于野生肺形侧耳种内鉴定,而且trn D-atp6效果最佳。