盐芥STZ转录因子基因的克隆及序列分析

编号 zgly0000807372

文献类型 期刊论文

文献题名 盐芥STZ转录因子基因的克隆及序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王荣  李晓峰  高飞  黄继昌  周宜君 

作者单位 阜阳师范学院生命科学学院  北京市科学技术委员会  中央民族大学生命与环境科学学院 

母体文献 西北农林科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012(9)

页码 215-220

年份 2012 

分类号 Q785 

关键词 盐芥  C2H2型锌指蛋白  转录因子STZ 

文摘内容 【目的】:克隆盐芥STZ转录因子基因,对其进行序列分析,为进一步研究ThSTZ转录因子在逆境应答中的作用奠定基础。【方法】:利用GenBank数据库中盐芥STZ转录因子的EST序列设计特异引物,通过3′RACE技术克隆ThSTZ基因的全长序列,应用生物信息学手段对该基因编码蛋白的结构与功能、亚细胞定位等进行预测,并对其编码氨基酸序列的同源性和系统进化进行分析。【结果】:盐芥STZ转录因子基因全长717bp,编码238个氨基酸。其编码蛋白含有2个C2H2型锌指结构域,位于细胞核内,属于C2H2家族转录因子;多重序列比对和系统进化分析表明,盐芥STZ转录因子与拟南芥属植物同源蛋白的相似性最高。【结论】:获得了ThSTZ转录因子基因的全长序列,为进一步探讨ThSTZ转录因子在逆境应答中的功能奠定了基础。