基于rDNAITS序列分析Alternaria与相似属的关系及A.leucanthemi的分类地位

编号 zgly0001316894

文献类型 期刊论文

文献题名 基于rDNAITS序列分析Alternaria与相似属的关系及A.leucanthemi的分类地位

作者 赵国柱  张天宇  曹爱新  王洪凯 

作者单位 山东农业大学植物病理学系  中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室  山东农业大学植物病理学系 山东泰安271018中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室  北京100080  山东泰安271018 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2006年02期

年份 2006 

分类号 Q931 

关键词 链格孢属  匍柄霉属  假格孢属  埃里格孢属  细基格孢属  系统学 

文摘内容 对Alternaria,Stemphylium,Ulocladium,Nimbya,Embellisia等五个形态相似属的代表性种进行了5.8S/ITS区段序列测定,连同从GenBank下载的相关有性型Pleospora,Lewia的同项资料,由Neighbor-joining方法构建系统发育树。序列对比结果显示,所有参试的菌株/种的5.8SrDNA序列保守程度较高,ITS序列变化较大,ITS1比ITS2变化更大。由5.8S/ITS构建的系统发育树可以足够将供试菌区分到属;系统发育树显示Alternaria,Ulocladium,Nimbya和Embellisia系统学关系较近,又存在一定的分化;Stemphylium聚在相对较远的分支上,与上述四属关系较远,相对独立进化;有性型的Pleospora与无性型的Stemphylium被聚到一个分支,这种不同阶段菌株在遗传基础上的一致,充分证明所用方法及所选测序的rDNA区段对本类群真菌的分类很有价值。Alternarialeucanthemi位于系统发育树的外侧,较为独立进化,与Alternaria的其它种亲缘关系较远,却与Stemphyliumspp.和Bipolarisspp.关系较近,对其目前的分类地位提出质疑。