意大利蝗转录组及性腺发育相关基因分析

编号 zgly0001563525

文献类型 期刊论文

文献题名 意大利蝗转录组及性腺发育相关基因分析

作者 向敏  叶小芳  扈鸿霞  王伟亮  于非  肖宏伟  季荣  王晗 

作者单位 新疆特殊环境物种多样性应用与调控实验室中亚区域跨境有害生物联合控制国际研究中心新疆师范大学生命科学学院  新疆玛纳斯县蝗虫鼠害预测预报防治站 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2017年11期

年份 2017 

分类号 S812.6 

关键词 意大利蝗  高通量测序技术  基因注释  卵巢  精巢 

文摘内容 【目的】意大利蝗Calliptamus italicus是新疆荒漠、半荒漠草原优势危害种类之一,其生殖相关基因信息缺乏。本研究对意大利蝗精巢和卵巢组织进行高通量转录组测序,旨在揭示意大利蝗转录组特征,并获得与性腺发育相关的基因数据。【方法】利用Illumina高通量测序平台(Hi Seq/Mi Seq)对意大利蝗进行了转录组测序,并进行序列分析。【结果】获得718 872条unigenes,平均长度631 bp,N50为1 186 bp。通过同源性比对,成功注释254 597条unigenes,其中,Nr数据库注释占28.87%,比例最高。Nr数据库注释的unigenes与黑褐草蚁Lasius niger的相似基因序列最多,为10.80%。与GO数据库比对发现,意大利蝗转录组unigene可分为3大类:涉及分子功能的unigenes有31 392条,涉及细胞组分的unigenes有20 586条,与生物学过程有关的unigenes有57 014条。KEGG pathways分析表明,23 666条unigenes归属于251个通路。涉及生殖系统发育的通路有卵母细胞减数分裂、胰岛素信号通路、Wnt信号通路、促性腺激素释放激素信号通路、转化生长因子β信号通路以及泛素介导的蛋白水解、黄体酮介导的卵母细胞成熟、昆虫激素生物合成等。进一步筛选得到部分与性腺发育相关的基因,包括vg,vgr,sox 21b,testis-specific serine/threonine-protein kinase,spermatogenesis-associated protein和vasa-like gene等。【结论】本研究获得了意大利蝗转录组数据及性腺发育相关基因,为进一步研究意大利蝗生殖调控机理奠定了分子基础。