菠萝基因组SSR分子标记的开发

编号 zgly0001378612

文献类型 期刊论文

文献题名 菠萝基因组SSR分子标记的开发

作者 童和林  冯素萍  陈友  陈业渊  孙光明  武耀廷 

作者单位 海南大学农学院  中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所  农业部热带作物生物技术重点开放实验室  琼州大学  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所 

母体文献 果树学报 

年卷期 2010年04期

年份 2010 

分类号 S668.3 

关键词 菠萝  基因组SSR标记  开发  验证 

文摘内容 实验采用SAM法,以台农17号菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证。利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这86条序列用MISA软件搜索后得到94个SSR位点,其中单核苷酸重复3个,二核苷酸重复91个。二核苷酸重复仅有2种重复单元,一种是GA/CT,占二核苷酸重复总数的57.14%(52/91),另一种是AC/GT,占二核苷酸重复总数的42.86%(39/91)。研究未发现三核苷酸及以上的重复单元。36对SSR引物对16个材料的扩增结果显示,24对引物能够扩增出清晰、重复性好且符合预期大小的条带,其中13对引物具有多态性,可成为下一步构建菠萝指纹图谱、遗传多样性分析及基因定位等研究中有用的SSR标记。