野生和室内饲养高原鼠兔肠道菌群多样性的比较

编号 zgly0001660811

文献类型 期刊论文

文献题名 野生和室内饲养高原鼠兔肠道菌群多样性的比较

作者 谭春桃  李欢  曲家鹏 

作者单位 中国科学院西北高原生物研究所  中国科学院大学  兰州大学公共卫生学院  青海省动物生态基因组学重点实验室 

母体文献 草业科学 

年卷期 2019年02期

年份 2019 

分类号 S852.6 

关键词 高原鼠兔  微生物  16SrRNA  高通量测序  操作分类单元  群落结构  青藏高原 

文摘内容 肠道微生物在宿主的生理活动、免疫调节以及健康方面均有重要的作用。尽管已有报道表明高原鼠兔肠道菌群和食物、环境有关,但对于野生和室内饲养条件下,取食不同食物的高原鼠兔肠道菌群是否存在差异尚不清楚。本研究利用16S rRNA基因高通量测序技术比较夏季野生和室内饲养高原鼠兔的肠道菌群发现,与野生鼠兔相比,室内鼠兔有更高丰度的拟杆菌门(Bacteroidetes)和螺旋体门(Spirochetes),更低丰度的变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。野生和室内饲养的鼠兔肠道共有的操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)有50.1%是重叠的,而49.9%的OTUs是各自特有的。野生和室内饲养肠道菌群的组成和群落结构(β多样性)有显著性差异。因此,室内饲养鼠兔不能有效反映野生状态下高原鼠兔肠道菌群的情况。