环境因子对中国柽柳遗传变异的影响

编号 zgly0001683899

文献类型 期刊论文

文献题名 环境因子对中国柽柳遗传变异的影响

作者 孙丽坤  刘光琇  张宝贵  章高森 

作者单位 甘肃农业大学  中国科学院西北生态环境资源研究所  太原师范学院 

母体文献 草业学报 

年卷期 2019年10期

年份 2019 

分类号 S793.5 

关键词 中国柽柳  核苷酸多样性  单倍型多样性  遗传分化  环境因子 

文摘内容 分别以核糖体DNA(nuclear ribosomal DNA, nrDNA)的内转录间隔区(internal transcribed spacer regions, ITS)和两条叶绿体DNA(chloroplast DNA, cpDNA)片段—trnL-trnF,rps16为分子标记,研究了20个自然分布的中国柽柳群体遗传变异与环境因子和地理距离间的相关性。结果表明:ITS序列(616 bp)中共发现了10个多态位点,定义了11种单倍型;总核苷酸多样性和总单倍型多样性分别为2.170和0.814。两个cpDNA分子标记片段的拼接序列(1542 bp)中共发现了14个多态位点,定义了16种单倍型,总核苷酸多样性和总单倍型多样性分别为0.500和0.586。ITS遗传多样性与地理、气候和土壤因子间相关性分析显示:海拔、温度和经度是影响中国柽柳群体遗传变异的主要因素。在低海拔、温暖和靠海近的湿润东部群体,ITS遗传多样性较高。而cpDNA的遗传变异与各种环境因子间没有显著的相关性。Mantel检测发现中国柽柳ITS的遗传变异与地理距离显著正相关,而cpDNA的遗传变异没有显著的地理渐变趋势,该结果进一步揭示了中国柽柳强大的种子流在降低群体间遗传分化上发挥了重要作用。