松材线虫耐药基因克隆及其功能

编号 zgly0001640429

文献类型 期刊论文

文献题名 松材线虫耐药基因克隆及其功能

作者 郝昕  王峰  马玲  王博文  马岩 

作者单位 东北林业大学  哈尔滨商业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2018年09期

年份 2018 

分类号 S763.18 

关键词 松材线虫  基因沉默  Bx-mrp1 

文摘内容 为探究松材线虫(Bursaphelenchus xylophilus)耐药的分子机理,对松材线虫耐药基因Bx-mrp1进行鉴定并对其蛋白结构及功能进行了研究。在松材线虫基因组数据中得到松材线虫与秀丽线虫(Caenorhabditis elegans) mrp1具有同源性的基因,命名为Bx-mrp1,并比较了松材线虫Bx-mrp1与相近线虫属之间的mrp基因差异。对松材线虫Bx-mrp1完整蛋白编码区(CDS)进行PCR扩增后,运用RNAi技术对该基因进行基因沉默,分析沉默该基因后对松材线虫死亡率的影响。通过PyM OL软件对Bx-MRP1蛋白质进行三维结构预测。结果表明:在NCBI中,通过BLAST比对,Bx-mrp1与秀丽线虫mrp1同源性为43%。Bx-MRP1蛋白质包含32个α螺旋和18个β折叠,以及含有3个TMD和2个NBD结构,具有多个跨膜结构域,表明Bx-mrp1具有跨膜运输的功能。通过PCR得到松材线虫Bx-mrp1基因CDS区全长为4 659 bp。在对Bx-mrp1基因沉默后,发现RNAi处理组的松材线虫在同质量浓度的苦参碱药剂胁迫下的死亡率有所增加,在多药耐药生理过程中起正向调控作用。