2018—2019年我国部分地区猪肺炎支原体多位点序列分型

编号 zgly0001710588

文献类型 期刊论文

文献题名 2018—2019年我国部分地区猪肺炎支原体多位点序列分型

作者 张慧  张安洁  刘爽  董雅琴  李晓成  魏荣 

作者单位 中国动物卫生与流行病学中心  云南农业大学动物医学院 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2020年07期

年份 2020 

分类号 S858.28 

关键词 猪肺炎支原体  多位点序列分型  p146基因  eBURST 

文摘内容 为了解我国猪肺炎支原体种群结构和进化关系,2018—2019年采集山东、广西、河南、江西、云南、天津、湖南等地猪组织样品1 242份,进行猪肺炎支原体荧光定量PCR和巢式PCR检测,并对测序确认的87份阳性样品,采用adk、rpoB、tpiA 3个管家基因作为分型参考进行多位点序列分型(MLST),并对3个管家基因均扩增成功的阳性样品进行p146基因分型,分析我国猪肺炎支原体种群结构,并结合pubmlst数据库公布的151个序列类型(ST)进行eBURST分析。结果显示:有24份阳性样品的3个管家基因全部扩增且测序成功,共分为10个ST,均为国内外首次报道;10个ST分为3个克隆复合体(CC)和4个独特型,其中ST128占41.7%(10/24),样品来自江苏、河南和广西,为本次检测的主要流行型。结果表明,我国猪肺炎支原体分布较广,具有一定的基因型独特性。本研究为我国猪肺炎支原体的流行病学数据库研究提供了新资料,有助于掌握国内猪肺炎支原体基因型分布情况,进一步完善了猪肺炎支原体流行病学数据库。