贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用

编号 zgly0000520099

文献类型 期刊论文

文献题名 贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用

作者 陈士超  杨红  李珊  祝建  傅承新 

作者单位 同济大学生命科学与技术学院  浙江大学生命科学学院系统进化植物学与生物多样性实验室 

母体文献 云南植物研究 

年卷期 2007,29(2)

页码 161-166

年份 2007 

分类号 Q332  Q949 

关键词 百合目  贝叶斯推论  rbcL  系统发育 

文摘内容 贝叶斯推论作为进化生物学的最新进展,在适用复杂模型、大型数据集、计算速度和结果容易解释等方面明显优于其它算法。本文简要介绍了贝叶斯推论原理及其在分子进化和系统发育研究中的重要性,并使用该方法对百合目主要类群的系统发育关系进行了重建。结果显示,百合目rbcL基因最适合的DNA进化模型为GTR＋I＋G,贝叶斯法与距离法和最大简约法构建的系统发育树拓扑结构相似,没有显著差异,但是分辨率和支持率明显比后者高。贝叶斯分析结果显示,百合目内划分的7个科,除Smilacaceae科外,其余各科均为高后验概率(PP=1·0)支持的单系类群;文中作者还对各科间的系统关系进行了探讨。