稻曲病菌的SCAR标记及其PCR检测

编号 zgly0001459771

文献类型 期刊论文

文献题名 稻曲病菌的SCAR标记及其PCR检测

作者 陈福如  林廷邦  甘林  杜宜新  阮宏椿  杨秀娟 

作者单位 福建省农业科学院植物保护研究所  福建农林大学植物保护学院 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2013年06期

年份 2013 

分类号 S435.111.4 

关键词 水稻  稻曲病菌  RAPD特异片段  SCAR标记  PCR检测 

文摘内容 为建立稻曲病菌Ustilaginoidea virens快速、灵敏的PCR早期检测技术,以S380为引物,对稻曲病菌和其它参试病原菌的DNA进行RAPD-PCR扩增。稻曲病菌RAPD特异片段经回收、克隆和测序后,根据序列用Primer 5.0软件设计了特异性SCAR引物US-SF(5’-TCGCCTCAGACCTCAATC-3’)/US-SR(5’-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3’)和巢式PCR引物US-NF(5’-AGCGTCTCCTGCAACCAC-3’)/US-NR(5’-GAGCCTCAAATGCCTTCC-3’)。利用引物US-SF/US-SR通过常规PCR对供试稻曲病菌均可扩增出1条大小约257 bp的清晰条带,对其它植物病原菌DNA的PCR产物均无扩增条带,最低可检测到1 pg/μL的病菌基因组DNA;而利用引物US-SF/US-SR和US-NF/US-NR通过巢式PCR可从10 fg/μL的病菌基因组DNA中扩增出1条大小约210 bp的特异性条带。试验表明,巢式PCR检测灵敏度比常规PCR提高了100倍,且巢式PCR可从接菌的水稻幼颖和自然感染的谷粒中检测出稻曲病菌。