BLASTALIGN在同源基因片段检索中的应用

编号 zgly0000521914

文献类型 期刊论文

文献题名 BLASTALIGN在同源基因片段检索中的应用

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 罗阿蓉  史卫峰  张彦周  周宏宇  乔慧杰  朱朝东 

作者单位 中国科学院动物研究所  中国科学院研究生院  泰山医学院  山西农业大学 

母体文献 动物分类学报 

年卷期 2007,32(4)

页码 861-864

年份 2007 

分类号 Q961 

关键词 BlastAlign  GenBank  小蜂总科  28S  rDNA  D2区 

文摘内容 多序列比对程序的开发在生物信息学中是一个很活跃的研究领域。作为一种新诞生的多序列比对程序,BlastAlign利用blastn算法进行序列比对,并且采用空位替代比对结果中的高变区。目前,该程序主要用于多条基因序列的比对研究。本文则以获取膜翅目小蜂总科28SrDNAD2区基因片段为例,通过应用BlastAlign的序列比对过程,提供一种较为简便和有效的方法,实现从GenBank数据库中检索并筛选特定的同源基因序列,从而克服目前利用关键词或检索式进行检索所存在的局限性。