魔芋软腐病病原菌TaqMan荧光探针PCR技术的建立及应用

编号 zgly0001690202

文献类型 期刊论文

文献题名 魔芋软腐病病原菌TaqMan荧光探针PCR技术的建立及应用

作者 卢美欢  李利军  马英辉  王晓兵  郭邦利  王晓娥 

作者单位 陕西省微生物研究所  西北农林科技大学植物保护学院  安康市岚皋县魔芋局  安康市农业科学研究院  汉中市农业科学研究所 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S436.32 

关键词 魔芋  软腐病  胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种  PCR  监测 

文摘内容 为实现对田间土壤软腐病病原菌的定量检测,基于魔芋软腐病优势病原菌胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum的FyuA基因序列,设计特异性引物PCC1/PCC2/PCC3,建立TaqMan荧光探针实时荧光定量PCR技术,并对魔芋根系土壤中软腐病病原菌进行动态监测。结果显示:基于FyuA基因序列设计的引物特异性好,仅能特异性检出胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种;当模拟带菌土壤中病原菌浓度低至1.88 CFU/g时也能检出,灵敏度高;发病魔芋根际土壤中软腐病病原菌检出率为100.00%,病原菌DNA浓度最高达到了7.52×10~7ng/μL,健康魔芋根际土壤中也存在病原菌,检出率为40.00%;不同种植模式中,林下魔芋土壤中软腐病病原菌数量较少;连作时间与病原菌数量、病情指数存在正相关关系,连作时间越长,病原菌积累越多,魔芋病情指数也越高,魔芋连作4年土壤中病原菌DNA浓度最高达到4.03×10~4ng/μL;对魔芋土壤软腐病病原菌进行全年监测,病原菌数量随着月份增长逐渐上升,在8—10月达到峰值543.20 ng/μL后下降,病原菌数量与魔芋病情指数变化规律一致,但田间魔芋软腐病的发生相对滞后。表明建立的TaqMan荧光探针实时荧光定量PCR技术可用于田间魔芋软腐病的监测。