草莓轻型黄边病毒的RT-PCR检测及其3’端序列分析

编号 zgly0001297190

文献类型 期刊论文

文献题名 草莓轻型黄边病毒的RT-PCR检测及其3’端序列分析

作者 杨洪一  张志宏  高秀岩  杜国栋  代红艳  李贺 

作者单位 沈阳农业大学园艺学院  沈阳农业大学园艺学院 沈阳110161  沈阳110161  沈阳110161 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2005年03期

年份 2005 

分类号 S436.68 

关键词 草莓  病毒  草莓轻型黄边病毒(SMYEV)  序列分析 

文摘内容 利用RTPCR技术对草莓植株中草莓轻型黄边病毒(SMYEV)的外壳蛋白基因片段进行特异扩增,扩增产物经测序证明为SMYEV的特异片段。建立了稳定的SMYEV的RTPCR检测体系,并对19个草莓品种和2种野生草莓进行检测,其中12个品种和五叶草莓带有SMYEV。从SMYEV的沈阳分离物SY01上扩增出了932bp的基因组3末端区域,其核酸序列与国外分离物的序列同源性为86%～96%。系统进化树显示SMYEV分为3个组群,沈阳分离物SY01与欧美分离物位于同一组群内,但独立形成1个小的分支。RNA二级结构分析显示SMYEV基因组3末端形成3个茎环结构,不同分离物的序列变化并未引起茎环结构的明显变化。