蕨类植物叶绿体rps12基因的分子进化研究

编号 zgly0001706443

文献类型 期刊论文

文献题名 蕨类植物叶绿体rps12基因的分子进化研究

作者 平晶耀  祝铭  苏应娟  王艇 

作者单位 华南农业大学生命科学学院  中山大学生命科学学院  中山大学深圳研究院  中国科学院华南植物园广东省应用植物学重点实验室 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 Q943.2 

关键词 蕨类植物  叶绿体  IR区  rps12基因  进化速率  GC含量  适应性进化 

文摘内容 以68种蕨类植物和2种石松类植物的rps12基因为对象,在系统发育背景下,结合最大似然法,使用HyPhy和PAML软件对该基因进行进化速率和适应性进化研究。结果显示:位于IR区的外显子2～3,其替换率明显降低,rps12基因编码序列的替换率也随之降低,且rps12基因密码子第3位的GC含量明显升高;在蕨类植物的进化过程中,3’-rps12更倾向定位于IR区,以保持较低的替换率; rps12基因编码的123个氨基酸位点中,共检测到4个正选择位点和116个负选择位点。研究结果表明基因序列进入到IR区后,显示出降低的替换率;强烈的负选择压力表明RPS12蛋白的高度保守性以及rps12基因的功能和结构已经趋于稳定。