支持向量机和邻接法在夜蛾科昆虫条码研究中的应用

编号 zgly0001419592

文献类型 期刊论文

文献题名 支持向量机和邻接法在夜蛾科昆虫条码研究中的应用

作者 李俊  韩辉林  高强  金倩  迟美妍  武春生  张爱兵 

作者单位 首都师范大学生命科学学院  东北林业大学林学院  中国科学院动物研究所 

母体文献 生物安全学报 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 S433.4  S763.42  Q969 

关键词 DNA条形码  夜蛾科  支持向量机  邻接法  近缘种 

文摘内容 【背景】鳞翅目夜蛾科昆虫种类繁多,目前已经超过3.5万种,绝大多数是农林生产的主要害虫。由于多数近缘属种形态相似,难以鉴定,给农林害虫的防治工作带了很大的困难。DNA条形码技术是一种快速、准确鉴定物种的方法。支持向量机作为一种新的机器学习方法,自1995年被提出以来已经在数据分类和高维模式识别等领域取得不错的效果。【方法】将北京妙峰山采集的58种夜蛾101个样品的COⅠ序列分成3套数据集,分别通过邻接法和支持向量机对其进行验证。【结果】通过对DNA条形码物种鉴定结果的验证表明,邻接法优于支持向量机。但DNA条形码在鉴定夜蛾科的一些近缘种上,效果不佳,如棉铃虫和烟青虫。【结论与意义】DNA条形码作为一种新兴的物种鉴定方法,在分类学上具有很高的应用价值。通过邻接法和支持向量机的比较,虽然支持向量机的成功率低于邻接法,但是其在DNA条形码中的应用是对数据问询方式的一种探索。