西伯利亚蓼几丁质酶基因ClassⅣ的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0000599076

文献类型 期刊论文

文献题名 西伯利亚蓼几丁质酶基因ClassⅣ的克隆及生物信息学分析

作者 刘关君  刘昌财  刘明坤  魏志刚  刘桂丰 

作者单位 林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室  中国人民解放军61699部队 

母体文献 植物生理学通讯 

年卷期 2008,44(3)

页码 476-484

年份 2008 

分类号 Q811.4  S572 

关键词 西伯利亚蓼  几丁质酶(CHI)  RACE  GPI锚 

文摘内容 根据西伯利亚蓼抑制消减文库(SSH)中获得的几丁质酶(CHI)基因的部分序列，采用RACE技术克隆了具完整编码区的cDNA序列，基因全长1017bp，开放阅读框编码270个氨基酸。序列分析表明，该基因的编码蛋白(PsCHI1)以前体形式存在，N端分别有22个氨基酸的信号肽和35个氨基酸的几丁质结合域(CBD)，C端199个氨基酸为催化区(CD)，连接CBD与CD的14个氨基酸为可变交联区，成熟蛋白为不含信号肽部分，呈碱性，带正电荷。PsCHI1与所选其它植物classⅣCHI前体序列具有高度的同源性(53％-69％)，而与classⅠ和classⅡCHI的氨基酸序列同源性较低，推测为植物classⅣCHI。根据日本水稻CHI晶体结构构建了PsCHI1三维分子模型，分析显示PsCHI1可以识别比classⅠ和classⅡCHI短的几丁质片段，并以其它植物CHI的已知结构域和功能为基础，确定PsCHI1具有能够水解真菌细胞壁的结构，推测其可能有抗病原微生物的功能。