马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因（CCR）克隆及分析

编号 zgly0000636243

文献类型 期刊论文

文献题名 马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因（CCR）克隆及分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 陈碧华 

作者单位 建省林业科学研究院林业生物技术研究开发中心国家林业局南方山地用材林栽培重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2009,45(12)

页码 46-53

年份 2009 

分类号 S718.46  Q943.2 

关键词 马尾松  肉桂酰辅酶A还原酶基因（CCR）  克隆  序列分析  系统进化树 

文摘内容 对马尾松肉桂酰辅酶A还原酶基因（CCR）进行扩增、克隆和测序（GenBank登录号：EU753854）。应用MEGA4.0.2软件对不同树种CCR基因的核苷酸和氨基酸序列进行比对,结果表明：马尾松CCR基因的外显子和内含子数目与火炬松、杨树、银合欢、光皮桦、冈尼桉、柳桉、蓝桉的外显子和内含子数目相同,都有5个外显子和4个内含子。马尾松CCR基因编码区975bp,编码324个氨基酸。马尾松外显子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,V分别为133,155,186,353,148bp,而内含子Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ分别为1450,216,737,941bp。马尾松CCR外显子和内含子连接处序列除内含子Ⅱ/外显子Ⅲ出现GTPuGG/外显子Ⅲ,其余遵循外显子/GTPuAG/外显子组成规律。马尾松外显子Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ核苷酸数目与桉属、杨属、桦木属和松属树种相同,但外显子Ⅰ和外显子Ⅴ不尽相同。比对的树种间在该基因编码区核苷酸序列和氨基酸序列上相对保守,也存在一定差异。马尾松与火炬松、光皮桦、银合欢、杨树、冈尼桉、柳桉、蓝桉各物种间编码区核苷酸序列相似性大小分别为99.2%,67.8%,68.0%,68.9%,69.5%,69.3%,69.9%,而相应的氨基酸序列间相似性大小分别为99.1%,73.5%,72.5%,74.4%,75.0%,74.4%,75.0%。马尾松与其他13个树种CCR序列构建的系统进化树表明：3个针叶树种形成1个独立分支,而且最早进化。