辣椒SSR标记种质资源遗传多样性的分析

编号 zgly0001566167

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒SSR标记种质资源遗传多样性的分析

作者 贾豪  魏小春  姚秋菊  原玉香  王志勇  姜俊  杨双娟  赵艳艳  王彬  张晓伟 

作者单位 河南省农业科学院园艺研究所  郑州大学生命科学学院生物工程系  河南省驻马店市农业科学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S641.3  Q943.2 

关键词 辣椒  SSR分子标记  遗传多样性  聚类分析 

文摘内容 辣椒资源遗传多样性丰富,育种的潜力大,本研究从分子水平研究不同种间辣椒种质资源的遗传多样性差异,为辣椒种质资源的收集、研究及合理利用提供参考。并首次利用基于辣椒全基因组编码区序列设计152对SSR辣椒基因组引物,用不同地理来源且性状差异显著的11个种(亚种)的24份辣椒种质资源对152对SSR引物进行筛选,从而获得条带清晰、稳定性好的41对SSR多态性引物,并利用NTSYS-pc2.10e和POPGENE32软件分析24份辣椒种质资源的遗传多样性数据。结果表明:41对SSR引物扩增出211个多态性条带,平均每对引物扩增出5.15个位点,说明SSR引物在辣椒遗传分析中有较高的实用性。有效等位基因数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、香农指数(Shannon-Weaver)(I)、多态信息含量(PIC)的均值结果分别为4.086 1、0.419 8、0.724 7、1.423 2、0.665 4,表明辣椒遗传信息非常丰富。UPGMA方法聚类分析及主成分分析将24份辣椒聚为7类,结果基本与辣椒种类来源相符。