香港红山茶个体内ITS多态性及物种鉴定的应用

编号 zgly0001496982

文献类型 期刊论文

文献题名 香港红山茶个体内ITS多态性及物种鉴定的应用

作者 范文  徐颖  许汀  徐晶  Takahiro Yonezawa  高继银  张文驹 

作者单位 复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室  中国科学院上海生命科学信息中心  广东棕榈风景园林科学研究院 

母体文献 植物学报 

年卷期 2015年02期

年份 2015 

分类号 S685.14 

关键词 香港红山茶  内转录间隔区(ITS)  系统发育  多态性  假基因 

文摘内容 核糖体DNA的内转录间隔区(ITS)一直被作为一种重要的分子标记,却很难用于山茶物种中。通过对1个疑似香港红山茶(Camellia hongkongensis)的样本进行ITS区域的扩增、克隆和测序,从中获得74种不同序列。研究结果表明,其ITS区域具有高度的多态性,其中76%的序列为假基因。系统发育分析显示,超过半数的假基因源自同一祖先。这些假基因在经历多次基因重复后分化成至少5个谱系,且每个谱系中的序列非常相似,这表明一些假基因不但未被剔除,反而通过快速复制事件幸存下来。由于山茶物种个体内ITS的高度多态,使用这个区域区分山茶物种可能导致错误。然而,通过比较香港红山茶中的1个种间特异性r DNA假基因,确定该样本属于香港红山茶。