毛竹全长LTR逆转座子的鉴定和进化分析

编号 zgly0000842367

文献类型 期刊论文

文献题名 毛竹全长LTR逆转座子的鉴定和进化分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 胡陶  马艳军  李雪平  刘秀丽  高健 

作者单位 国际竹藤中心  国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室  北京林业大学园林学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2014(6)

页码 1265-1274

年份 2014 

关键词 毛竹  转座因子  长末端重复序列型逆转座子  进化  基因组 

文摘内容 转座子和逆转座子的大量插入,是高等植物基因组进化的重要动力。作为植物基因组研究热点的禾本科植物之一,毛竹基因组大小约为2 Gb,60%为重复序列,长末端重复序列型逆转座子(LTR逆转座子)则占全部重复序列的一半以上,然而目前对毛竹基因组中LTR逆转座子及进化情况知之甚少。本研究利用已发表的毛竹基因组序列,首次通过大数据筛查预测获得9 436个平均长度10.3 kb的全长LTR逆转座子。通过分析,我们估算出毛竹LTR逆转座子插入基因组的时间主要分布于200~500万年前,晚于毛竹基因组四倍化的时间。