犬瘟热病毒H基因的序列分析

编号 zgly0001569351

文献类型 期刊论文

文献题名 犬瘟热病毒H基因的序列分析

作者 李丹丹  戚伟强  李传峰  刘柱  陈宗艳  张淼涛  刘光清 

作者单位 西北农林科技大学动物医学院  中国农业科学院上海兽医研究所 

母体文献 西北农林科技大学学报(自然科学版 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 S852.655 

关键词 犬瘟热  H基因同源性  进化方式  天冬酰胺糖基化位点 

文摘内容 【目的】探索犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)基因的遗传变异情况,为CDV的防控提供理论依据。【方法】收集2014-2015年流行于上海和安徽两地的CDV野毒株,用RT-PCR方法克隆其血球凝集素蛋白基因(H),从分子水平上讨论CDV H基因的流行规律、遗传进化特性和变异情况。【结果】分离的5株CDV之间H基因核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为97.5%~99.9%和97.5%~99.2%,其与CDV疫苗株CDV3和Onderstepoort H基因核苷酸的同源性为90.9%~99.9%,氨基酸的同源性为90.4%~99.6%。进化树分析结果表明,分离到的5株CDV野毒株均属于亚洲Ⅰ型,与大部分的亚洲Ⅰ型处于同一分支。CDV H基因有9处潜在的天冬氨酸糖基化位点;H基因整体的同义突变概率与非同义突变概率的比例,即ds/dn=5.887 0。【结论】选择压力并未作用于分离到的CDV毒株,而是在中性选择作用下进化的。