垃圾填埋场渗滤液中古细菌群落16S rRNA基因的ARDRA分析

编号 zgly0000288622

文献类型 期刊论文

文献题名 垃圾填埋场渗滤液中古细菌群落16S rRNA基因的ARDRA分析

作者 黄立南  周惠 

作者单位 中山大学生命科学学院  基因工程教育部重点实验室 

母体文献 生态学报 

年卷期 2002,22(7)

页码 1085-1090

年份 2002 

分类号 X172  X705 

关键词 垃圾填埋场  渗滤液  古细菌群落  ARDRA分析  16S  rRNA基因 

文摘内容 利用特异性的引物对, 选择性扩增垃圾填埋场渗滤液中古细菌群落的18S rRNA基因片断, 在此基础上建立16S rDNA克隆文库, 经古细菌通用寡核苷酸探针的原位杂交筛选后, 克隆文库内古细菌16S rDNA扩增片断的多样性通过ARDRA分析(amplified rDNA restriction analysis)而获得, 利用PCR将各组重克隆子内的16S rDNA外源片断再扩增出来后,两种限制性内切酶-Hha I和HaeⅢ-被分别用于16S rDNA克隆片断的限制酶切分析, 结果表明, 随机选出的70个古细菌16S rDNA克隆片断被妥为21个不同的ARDRA型(组), 其中的两个优势型总共占了所有被分析克隆子的60%, 而其余19个型的相对丰度均处于较低的水平, 当中的14个型更仅含有1个克隆子, 通过对16S rRNA基因的PCR扩增, 克隆及其ARDRA分析, 能快速地获得有关填埋场渗滤液中古细菌群落的结构及其多样性的初步信息。