基于家族分析的苜蓿逆境应答Ca2+ ATPase家族基因筛选与鉴定

编号 zgly0001568379

文献类型 期刊论文

文献题名 基于家族分析的苜蓿逆境应答Ca2+ ATPase家族基因筛选与鉴定

作者 张美萍  杨珺凯  孙明哲  贾博为  孙晓丽 

作者单位 黑龙江八一农垦大学作物逆境分子生物学实验室 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2017年02期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S541 

关键词 苜蓿  Ca2+ ATPase  家族分析  逆境应答  表达分析 

文摘内容 Ca2+ ATPase属于P型ATPase超家族,在植物对外界逆境的应答中发挥重要作用,但迄今尚未有苜蓿Ca2+ ATPase基因研究的相关报道。为筛选逆境胁迫应答Ca2+ ATPases,本研究鉴定获得了16个苜蓿Ca2+ ATPase家族成员,分布在7条染色体上,且存在一对旁系同源基因。系统进化分析表明苜蓿Ca2+ ATPases分为ACA和ECA亚家族,ACA亚家族分为4组,且组内成员具有相似的内含子-外显子组成模式。此外,苜蓿Ca2+ ATPase家族具有高度保守的蛋白序列组成,包括4个功能结构域、10个跨膜结构域和11个保守motif。转录组数据分析发现该家族具有不同的逆境诱导表达模式,且多数苜蓿Ca2+ ATPases家族基因受低温和冷冻胁迫诱导表达,其中Mt ACA9和Mt ACA8上调表达最明显。q RT-PCR结果证实Mt ACA9和Mt ACA8表达在低温和冷冻胁迫下显著上调。本研究结果为揭示苜蓿Ca2+ ATPase基因在低温冷害应答中的功能提供了重要参考。