16S rRNA基因在微生物生态学中的应用

编号 zgly0000972160

文献类型 期刊论文

文献题名 16S rRNA基因在微生物生态学中的应用

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘驰  李家宝  芮俊鹏  安家兴  李香真 

作者单位 中国科学院环境与应用微生物重点实验室  环境微生物四川省重点实验室中国科学院成都生物研究所  中国科学院大学 

母体文献 生态学报 

年卷期 2015(9)

页码 2769-2788

年份 2015 

关键词 16S rRNA基因  微生物群落  多样性  高通量测序  生物信息数据处理 

文摘内容 16S rRNA(Small subunit ribosomal RNA)基因是对原核微生物进行系统进化分类研究时最常用的分子标志物(Biomarker),广泛应用于微生物生态学研究中。近些年来随着高通量测序技术及数据分析方法等的不断进步,大量基于16S rRNA基因的研究使得微生物生态学得到了快速发展,然而使用16S rRNA基因作为分子标志物时也存在诸多问题,比如水平基因转移、多拷贝的异质性、基因扩增效率的差异、数据分析方法的选择等,这些问题影响了微生物群落组成和多样性分析时的准确性。