红富士苹果芽变系DNA甲基化研究

编号 zgly0001659530

文献类型 期刊论文

文献题名 红富士苹果芽变系DNA甲基化研究

作者 杜晓云  宋来庆  赵玲玲  刘美英  唐岩  孙燕霞  姜中武  束怀瑞 

作者单位 烟台市农业科学研究院  烟台大学  山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S661.1 

关键词 富士苹果  着色系芽变  DNA甲基化  甲基化敏感扩增多态性  表观遗传变异 

文摘内容 以35份富士苹果(Malus×domestica Borkh.‘Fuji’)芽变材料为试材,利用甲基化敏感扩增多态性(Methylation Sensitive Amplified Polymorphism,MSAP)分析和UPGMA聚类方法,对其基因组甲基化修饰水平、变异模式以及表观遗传变异关系进行研究。结果表明:(1)不同富士系得到不同的MSAP扩增,总DNA甲基化水平27.90%～36.16%,平均32.87%,双链全甲基化为主要甲基化方式;(2)富士芽变材料绝大多数位点保持了原有甲基化模式;(3)绝大多数芽变(68.57%)检测到全部的甲基化变异模式(12种),去甲基化频率极显著高于甲基化频率(P <0.01),且CG去甲基化极显著高于CHG;(4)36份种质遗传相似系数平均值0.89(0.79～0.92),在聚类图上,富士原种分布在芽变系集中区外,新近发生的芽变系更倾向于聚在一起,着色系片红型和条红型芽变呈分散排布状态。总的来看,富士芽变的甲基化变异模式丰富,超甲基化和去甲基化相伴发生,但以去甲基化为主;‘富士’着色芽变与其最原始品种富士,以及芽变之间发生了较大表观遗传变异;片红和条红型芽变聚类未表现明显偏好性。本研究将为进一步开展富士着色系芽变机理研究提供指导,可以CG去甲基化为切入点展开深入研究。