杨树ARGONAUTE基因的克隆及序列分析

编号 zgly0000716524

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树ARGONAUTE基因的克隆及序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 胥猛  谢雯凡  潘惠新  苏晓华  张守攻  黄敏仁 

作者单位 南京林业大学江苏省杨树种质创新与品种改良重点实验室  中国林业科学研究院林业研究所 

母体文献 林业科学 

年卷期 2011,47(3)

页码 46-51

年份 2011 

分类号 S718.46 Q943.2 

关键词 杨树  硬枝插穗  Argonaute蛋白  表达模式  qRT-PCR 

文摘内容 作为RNA诱导沉默复合体的核心元件,Argonaute(AGO)蛋白在植物生长发育过程中发挥着重要作用。以欧美杨和美洲黑杨不定根cDNA为模板,采用RT-PCR技术分离得到PeAGO5和PdAGO5基因的cDNA克隆,测序和序列分析结果表明2个目的cDNA片段均为2809bp,基因内部含有完整的开放阅读框,可编码907个氨基酸,预测蛋白质分子量分别为102.31ku和102.34ku,理论等电点(pI)分别为9.34和9.7。所推导的2个氨基酸序列之间仅有7个差异位点,含有3个保守的结构域,DUF1785、PAZ和Piwi结构域。它们与拟南芥AtAGO5蛋白的相似性分别为64.8%和64.3%,故将其命名为PeAGO5和PdAGO5。系统进化分析发现,PeAGO5和PdAGO5,与拟南芥AtAGO1,AtAGO5和AtAGO10蛋白同属一个进化分支。此外,采用实时定量PCR技术检测PeAGO5基因在杨树硬枝插穗不定根发育过程中的表达模式,推测该基因参与不定根发育调控。