新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001566193

文献类型 期刊论文

文献题名 新疆野扁桃AlsCBF1-A基因的克隆及生物信息学分析

作者 代培红  郭龙  李月  姚正培  罗淑萍  徐叶挺  刘鹏程  李疆 

作者单位 新疆农业大学农学院  新疆农业科学院园艺作物研究所  新疆农业大学林学与园艺学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S662.9  Q943.2 

关键词 野扁桃  转录因子  CBF基因  抗寒 

文摘内容 以野扁桃为实验材料,提取叶片的RNA,设计基因特异性引物,利用RT-PCR克隆转录因子CBF的c DNA全长,命名为Als CBF1-A(登录号KU975456);并对其基因和蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,该转录因子基因的CDS区长699 bp,编码232个氨基酸,编码蛋白相对分子质量约为26.027 2 k D,p I 4.84;由无规则卷曲(C),α-螺旋(H),β-折叠(E)组成,分别占52.17%,21.74%和26.09%;有较强的亲水性,无跨膜区和信号肽存在,有8处丝氨酸磷酸化位点、2处苏氨酸磷酸化位点、2处酪氨酸磷酸化位点;同源性分析表明Als CBF1-A基因在高等植物中保守性较高。本研究显示CBF转录因子可能与野扁桃的抗寒性相关,此研究为野扁桃抗寒分子机理的进一步研究提供了帮助。