线粒体基因组测序策略和方法

编号 zgly0001447825

文献类型 期刊论文

文献题名 线粒体基因组测序策略和方法

作者 沙淼  林立亮  李雪娟  黄原 

作者单位 陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 应用昆虫学报 

年卷期 2013年01期

年份 2013 

分类号 Q963 

关键词 线粒体基因组  长PCR  引物步移法  高通量测序 

文摘内容 本文综述了线粒体基因组测序策略和方法,在传统测序方法中介绍了基于物理分离线粒体DNA的克隆文库测序方法和基于PCR扩增产物的直接测序方法,后者重点介绍了基于长PCR扩增产物的引物步移法和基于总DNA的引物步移法;应用新一代高通量测序方法有基于总DNA样品的方法,包括需要预扩增mtDNA的多物种平行高通量和无需预扩增mtDNA的高通量方法,基于总RNA样品的转录组测序方法等。在实际工作中,选择哪种方法取决于研究规模、样品大小和保存状态、经费情况等。总的来说,基于长PCR扩增产物的引物步移法尤其适合小规模昆虫线粒体基因组研究,而对于大规模线粒体基因组研究来说,NGS技术无疑是省时省力的最佳选择。