油茶栽培品种SSR指纹图谱构建及聚类分析

编号 zgly0001566237

文献类型 期刊论文

文献题名 油茶栽培品种SSR指纹图谱构建及聚类分析

作者 周文才  温强  杨军  王建文  徐立安  徐林初 

作者单位 江西省林业科学院  婺源县林业局林业科技推广站  南京林业大学南方现代林业协同创新中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年01期

年份 2017 

分类号 S794.4 

关键词 油茶  指纹图谱  SSR  聚类分析  品种鉴定 

文摘内容 本研究首次利用从油茶DNA序列中开发的SSR标记及其近缘种通用性的SSR标记开展油茶栽培品种的分子甄别研究。7对通用性高、多态性好、扩增清晰的SSR标记构建了油茶43个栽培品种的DNA指纹图谱。遗传参数统计显示,43个油茶品种遗传多样性指数为0.347 1,Shannon指数为0.517 2;7对SSR引物扩增共得到位点36个,其中多态性位点35个,位点多态性达97.22%,其中利用4个标记CO_g SSR16、CO_gssr37、CO_e SSR4和CO_e SSR44两两组合可以完全鉴别出43个油茶栽培品种。聚类结果表明油茶品种的亲缘关系与地理来源存在一定的相关性,如来自江西的赣无系列品种大多能够成组聚类,而来自广西的品种(桂软11号,桂软24号,岑软2号,陆川大果)与来自越南的品种(和江2号,越南油茶,东孝2号)聚在一个类群;但也有一些品种地理来源不同而同样聚在同一类群,显示了油茶遗传背景的多样性与复杂性。本研究为油茶品种鉴定及遗传学研究等提供技术基础及理论依据。