一株类禽型H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征

编号 zgly0001675372

文献类型 期刊论文

文献题名 一株类禽型H1N1猪流感病毒的进化分析与分子特征

作者 李鑫  葛菲菲  刘健  李壮壮  吴杰  杨德全  鞠厚斌  周锦萍 

作者单位 上海市动物疫病预防控制中心  扬州大学生物科学与技术学院 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S852.651 

关键词 猪流感病毒  H1N1  类禽型  遗传进化树  分子特征 

文摘内容 2017年12月,上海市一养殖场饲养的猪出现咳嗽、呼吸困难、发热及迅速转归等病症。将猪鼻拭子接种鸡胚进行病毒分离,对血凝试验阳性样品在SPF鸡胚上进一步纯化、增殖,分离到1株猪流感病毒(A/swine/Shanghai/1205/2017)。采用RT-PCR对分离毒株进行全基因组扩增测序,利用DNAstar软件,对测序基因片段进行整个阅读框的核苷酸序列同源性比对分析,并用MEGA 6绘制遗传进化树并分析氨基酸位点。结果显示:分离毒株为H1N1亚型,其8个基因片段均属于类禽型H1N1进化分支,没有出现不同基因型流感病毒片段之间的重组;分离株HA蛋白的裂解位点序列为PSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子特征。本毒株的分离鉴定为分析我国大陆地区的猪流感流行状况和分子特征提供了参考。