高通量测序和DGGE分析土壤微生物群落的技术评价

编号 zgly0000889379

文献类型 期刊论文

文献题名 高通量测序和DGGE分析土壤微生物群落的技术评价

学科分类 220.1040;森林土壤学

作者 夏围围  贾仲君 

作者单位 中国科学院南京土壤研究所  土壤与农业可持续发展国家重点实验室  中国科学院大学 

母体文献 微生物学报 

年卷期 2014(12)

页码 1489-1499

年份 2014 

关键词 高通量测序  变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis  DGGE)  土壤微生物群落 

文摘内容 【目的】比较新一代高通量测序与传统的变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE)指纹图谱技术,评价两种技术研究土壤微生物群落结构的优缺点。【方法】针对新西兰典型草地和森林土壤,以16S rRNA基因为标靶,通过高通量测序和DGGE技术分析土壤微生物群落的组成、丰度和多样性,比较两种方法在土壤微生物研究中的适用性。【结果】在不同的微生物分类水平,高通量测序草地土壤检测到22门,54纲,60目,131科,350属;而DGGE仅检测到6门,9纲,8目,10科,10属,表明DGGE显著低估了土壤微生物的群落组成。