石斛内生炭角菌DNA提取方法优化及分子鉴定

编号 zgly0001577724

文献类型 期刊论文

文献题名 石斛内生炭角菌DNA提取方法优化及分子鉴定

作者 钟志敏  赖小平  黄松  张桂芳 

作者单位 广州中医药大学中医药数理工程研究院  广东省中药新药研发重点实验室 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 Q933 

关键词 石斛  炭角菌  优化CTAB法  菌种鉴定 

文摘内容 本文对石斛内生炭角菌DNA提取方法进行优化,并基于ITS序列及其ITS2二级结构对其进行分子鉴定。比较试剂盒法及不同浓度(2%、3%、4%)CTAB法的DNA提取效果并对CTAB法进行优化;进行ITS序列的扩增及ITS2二级结构的预测。结果表明:4%的CTAB提取效果最佳,优化的CTAB法大大缩短了DNA提取时间;ITS序列与炭角菌属3个种的相似度均为99%,ITS2二级结构仅与Xylaria arbuscula的二级结构100%相似。本研究所优化的CTAB法能为后续相关研究提供便利;结合ITS序列及ITS2二级结构能对石斛内生炭角菌进行准确的分子鉴定。