基于16S rDNA序列比对分析赣南脐橙上柑橘黄龙病病原的分子特征

编号 zgly0001397129

文献类型 期刊论文

文献题名 基于16S rDNA序列比对分析赣南脐橙上柑橘黄龙病病原的分子特征

作者 易龙  卢占军  钟八莲  赖晓桦  陈慈相 

作者单位 赣南师范学院生命与环境科学学院  江西省脐橙工程技术研究中心 

母体文献 果树学报 

年卷期 2011年06期

年份 2011 

分类号 S436.66 

关键词 赣南脐橙  柑橘黄龙病  16S rDNA  RFLP分析  序列比对 

文摘内容 运用PCR技术以柑橘黄龙病病原亚洲种、非洲种和美洲种特异性引物对赣南脐橙上7个代表性柑橘黄龙病样品进行扩增检测,结合限制性内切酶XbaⅠ对赣南脐橙上的黄龙病病原16S rDNA基因RFLP分析和测定的16SrDNA基因序列同GenBank登录的亚洲种、非洲种和美洲种的相应基因序列进行比对分析。结果表明,在赣南脐橙上检测到黄龙病病原亚洲种,未检测到非洲种和美洲种;赣南脐橙上黄龙病病原16S rDNA基因XbaⅠ酶切具有亚洲种图谱;16S rDNA基因序列比对分析表明7个赣南脐橙上的黄龙病病原间同源性为99.8%~100%,与亚洲种具有98.4%~99.9%的序列同源性,高于与非洲种/美洲种的序列同源性;与亚洲种间遗传距离小于与非洲种/美洲种间的遗传距离;系统聚类分析表明7个赣南脐橙上的黄龙病病原同亚洲种聚类在同一组群,具有较高的同源性和较近的亲缘关系,而与非洲种和美洲种在系统发育树中分属不同的组群,试验结果表明赣南脐橙上感染的黄龙病病原为亚洲种。