基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析

编号 zgly0001337904

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析

作者 忻雅  阮松林  王世恒  马华升  王伟科  王淑珍 

作者单位 杭州市农业科学研究院 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2008年04期

年份 2008 

分类号 S646.1 

关键词 秀珍菇  RAPD标记  EST-SSR标记  聚类分析 

文摘内容 本研究利用RAPD标记和EST-SSR标记对10个不同来源的秀珍菇菌株进行聚类分析。200条RAPD引物中127条有扩增产物。引物可用率为63.5%。从NCBI数据库中下载秀珍菇及相近侧耳属食用菌EST序列2167条,聚类比对后得到全长为713.541 kb的非冗余EST 1442条,搜寻后得到的29个EST-SSR全部设计引物,其中26对引物(89.7%)显示多态性。根据17条RAPD核心引物和10对EST-SSR核心引物的扩增结果,对10个秀珍菇菌株进行了RAPD标记、EST-SSR标记及二者相结合的聚类分析。3种分析结果相近,且与菌丝、子实体生长特性分析结果相统一—10个供试菌株区分为5组:1～4号菌株为一组,6号和7号菌株为一组,8号和9号菌株为一组,5号和10号菌株各自为一组。