带环境效应的基因组选择方法研究

编号 zgly0001007727

文献类型 期刊论文

文献题名 带环境效应的基因组选择方法研究

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 袁志凯  熊思灿 

作者单位 武汉大学数学与统计学院  东华理工大学理学院 

母体文献 应用数学 

年卷期 2016(1)

页码 225-232

年份 2016 

关键词 基因组选择  混合线性模型  惩罚函数法  坐标下降算法 

文摘内容 本文主要研究带环境效应的基因组选择问题,通过把环境效应处理成固定效应,而标记效应处理成随机效应,建立混合线性模型,并首先采用极大似然法给出环境效应和模型方差的估计,然后利用基于改进的单变量惩罚解的坐标下降算法求解基于残差的惩罚目标函数,实现标记效应的变量选择.模拟结果表明,本文所提的两步估计法在带环境效应的基因组选择中快速高效,且MCP惩罚函数表现最好,SCAD次之,而LASSO和EN表现最差。