胡杨无性系幼苗响应盐胁迫的miRNA表达差异研究

编号 zgly0001497081

文献类型 期刊论文

文献题名 胡杨无性系幼苗响应盐胁迫的miRNA表达差异研究

作者 司婧娜  周韬  徐放  薄文浩  邬荣领 

作者单位 北京林业大学计算生物学中心林木遗传育种国家工程实验室生物科学与技术学院 

母体文献 植物研究 

年卷期 2015年06期

年份 2015 

分类号 S792.11 

关键词 高通量测序  miRNAs  胡杨  盐胁迫 

文摘内容 植物mi RNA在调控基因表达、细胞周期、生物体发育、抗逆等方面起重要作用。为研究胡杨(Populus euphratica Oliv.)的耐盐机制,以1年生胡杨无性系幼苗为材料,构建具有空间代表性的盐胁迫胡杨c DNA文库,利用二代测序技术测定Na Cl胁迫下和正常培养条件下胡杨叶和根mi RNA表达情况。结果表明,不同的mi RNA之间表达量存在明显差异,表达丰度最高的mi RNA有mi R156、mi R157、mi R165、mi R166和mi R167等,合计占总表达量的90%以上。胡杨根部存在特异表达的mi RNA,在整个耐盐调控机制中发挥着生理调节、分子调控和信号传导等极为重要的作用。盐处理样品中发现大量响应盐胁迫的mi RNA,对这些转录因子进行靶基因预测和注释后,发现很多盐胁迫响应的mi RNA与NAC和SPL等重要转录因子家族相关,与前人的结论一致,另外还发现许多mi RNA的调控对象是ATP酶和激素响应因子。