渐绿木霉基因组中PKS和NRPS基因的多样性分析

编号 zgly0001644900

文献类型 期刊论文

文献题名 渐绿木霉基因组中PKS和NRPS基因的多样性分析

作者 叶美金  郭海霞  杨财容  薛飞龙  刘红玲 

作者单位 成都师范学院化学与生命科学学院  四川农业大学小麦研究所  石河子大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年14期

年份 2018 

分类号 S476.1 

关键词 渐绿木霉  多样性  聚酮合成酶  非核糖体多肽合成酶 

文摘内容 为了探究渐绿木霉(Trichoderma viridescens)基因组中聚酮合成酶(polyketide synthase,PKS)和非核糖体多肽合成酶(non-ribosomal peptide synthase,NRPS)的多样性,为寻找合成生物活性物质的潜在菌株提供科学依据。本研究通过18S rDNA序列分析,鉴定菌株SC-1为渐绿木霉(T.viridescens);利用兼并性引物对菌株SC-1的PKS和NRPS基因进行PCR扩增及序列测定分析,构建系统发育树,明确菌株SC-1的PKS和NRPS基因序列的系统进化地位。结果表明,菌株SC-1基因组中含有PKS I、NRPS基因片段;经比对,PKS I基因片段与已知Trichoderma atroviride PKS序列相似度为96%,NRPS基因片段与Trichoderma gamsii NRPS序列相似度为97%。本研究结果为渐绿木霉具有产生活性次生代谢产物的潜力,值得进一步开发研究和应用。