燕麦镰孢菌环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立与应用

编号 zgly0001644664

文献类型 期刊论文

文献题名 燕麦镰孢菌环介导等温扩增(LAMP)检测方法的建立与应用

作者 漆永红  曹素芳  李雪萍  李敏权 

作者单位 甘肃省农业科学院植物保护研究所  甘肃农业大学草业学院  甘肃省农业科学院林果花卉研究所 

母体文献 草地学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S435.123 

关键词 青稞  茎基腐病  燕麦镰孢菌  环介导等温扩增(LAMP) 

文摘内容 为了明确燕麦镰孢菌(Fusarium avenaceum)快速检测方法,以荧光染料SYBR Green I为指示剂,以燕麦镰孢菌(F.avenaceum)的ITS序列为目的 DNA片段,应用LAMP设计软件设计4条引物,优化LAMP反应体系和反应条件,用2%琼脂糖凝胶电泳和LAMP反应液颜色变化进行特异性和灵敏度验证,同时进行田间发病组织检测和土壤燕麦镰孢菌灵敏度验证。结果表明:优化的LAMP反应体系,最佳反应温度为65℃,反应程序为65℃下1h,80℃下20min。特异性检测结果表明,燕麦镰孢菌LAMP检测均呈黄绿色(阳性),对照和其他病原菌均呈橘色(阴性)。灵敏度验证结果表明,LAMP反应液检测灵敏度在DNA水平达到10pg·μL-1,每克土壤中检测的灵敏度为40个燕麦镰孢菌孢子。对采自甘肃省甘南州卓尼县和临潭县的20份疑似病害样本提取的DNA进行检测,其中13份为阳性,表明该技术能够有效的检测出青稞发病组织中的燕麦镰孢菌。本方法的建立与应用能为燕麦镰孢菌的检测及其青稞茎基腐病的诊断提供一种新技术。