甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性

编号 zgly0000797071

文献类型 期刊论文

文献题名 甜樱桃DFR基因内含子2和内含子3的多态性

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王廿  鄢锦辉  张开春  王晶  张晓明  闫国华 

作者单位 北京市农林科学院林业果树研究所  北京市大兴区兴海学校 

母体文献 中国农业科学 

年卷期 2012,45(2)

页码 320-329

年份 2012 

分类号 S432.23 

关键词 甜樱桃  DFR基因  果皮颜色  等位基因频率  基因多态性 

文摘内容 【目的】研究70个甜樱桃品种DFR基因多态性与果皮颜色的相关性。【方法】通过DNA序列分析,以不同果皮颜色的10个甜樱桃品种(Prunus avium L.)为材料,检测DFR基因的多态性。根据多态性出现的位点设计特异引物,通过PCR扩增检测70个甜樱桃品种DFR基因的多态性。【结果】获得甜樱桃DFR基因约1 kb的片段,测序结果用BLAST分析发现,其核苷酸序列与樱桃李(Prunus cerasifera)的核苷酸相似性为80%,预测的氨基酸序列与已知的甜樱桃(P.avium)DFR氨基酸序列相似性达99%。该片段由3个外显子和3个内含子组成,2个多态性位点分别在内含子2和内含子3上。在黄色、黄底红晕和红色果皮3个组的70个甜樱桃品种中发现3个单倍型,共5种单倍型组合。通过SAS 9.0软件分析发现,所检测到的DFR基因的等位基因频率在黄底红晕果皮品种组和红色品种果皮组中的分布无显著差异。【结论】本研究在甜樱桃DFR基因座上得到2个差异位点,分别在内含子2和内含子3内,其优势基因频率依次为: 0.864和0.679;但未发现DFR基因内含子2和内含子3的多态性与果皮颜色之间存在直接关系。