基于SSR分析的富民枳样本量对其遗传多样性指标的影响

编号 zgly0001546827

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR分析的富民枳样本量对其遗传多样性指标的影响

作者 张珊珊  杨文忠  张玉萍  高雪松  康洪梅 

作者单位 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室(云南省林业科学院)  昆明市濒危动植物收容拯救中心 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2017年09期

年份 2017 

分类号 S666 

关键词 极小种群野生植物  富民枳(Poncirus polyandra)  遗传完整性  有效样本量  遗传多样性指标 

文摘内容 为了对极小种群野生植物富民枳(Poncirus polyandra)采取合理有效的保护措施,采用SSR分子标记作为遗传完整性检测标记,研究不同梯度的有效样本量对微卫星分析中遗传多样性指标的影响。本研究利用5对SSR引物,对65份富民枳种质材料进行遗传完整性检测,并对富民枳种植资源遗传多样性的微卫星数据进行分析。结果表明:随着有效样本量的增加,有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、多态性信息量和Shannon信息指数等遗传指标均随之增加,有效样本量与遗传多样性指标呈显著正相关。当以有效等位基因数、多态性信息量(PI,C)和Shannon多样性指数等来衡量时,有效样本量29株为曲线的拐点,此时代表了95%以上的遗传多样性水平;而以观测杂合度和期望杂合度来衡量时,有效样本量为25株时,便达到了该总体遗传多样性水平的95%以上。综合分析表明,富民枳的有效样本量以25~29株较为合适,目前富民枳的种质保存是合理有效的。