基于血凝素裂解位点的DNA条形码在A型流感病毒分型中的应用

编号 zgly0001487943

文献类型 期刊论文

文献题名 基于血凝素裂解位点的DNA条形码在A型流感病毒分型中的应用

作者 孟慧芝  孙涛  岳志芹  王文斌 

作者单位 山东出入境检验检疫局  山西农业大学 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2015年07期

年份 2015 

分类号 S852.65 

关键词 A型流感病毒  血凝素(HA)  DNA条形码  亚型鉴定 

文摘内容 为了建立一种快速鉴别AIV的HA亚型的RT-PCR方法,本研究探讨了流感病毒血凝素裂解位点基因作为DNA条形码对A型流感病毒进行亚型鉴定的可行性。通过生物信息学方法对16种A型流感病毒的血凝素基因全长进行比对,在HA裂解位点的两端高度保守区设计一对DNA条形码引物,RT-PCR扩增获得约170bp的核苷酸片段。利用MEGA5.0软件构建N-J系统树并计算亚型间及亚型内平均遗传距离。结果显示,不同A型流感病毒裂解位点氨基酸具有单系性,每一亚型可分别形成各自独立的分支。不同亚型间平均遗传距离为0.277,相同亚型内平均遗传距离0.032。研究表明,利用DNA条形码技术可在A型流感病毒分型方面进行有效的分子分类鉴定。