圆斑星鲽MHC ⅡB基因结构、多态性及组织表达分析

编号 zgly0000705892

文献类型 期刊论文

文献题名 圆斑星鲽MHC ⅡB基因结构、多态性及组织表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李宏俊  王娟  高祥刚  苏浩  刑坤  傅立元  赫崇波 

作者单位 辽宁省海洋水产科学研究院  辽宁省海洋水产分子生物学重点实验室  辽宁师范大学生命科学学院 

母体文献 中国水产科学 

年卷期 2011,18(2)

页码 299-307

年份 2011 

分类号 Q959 

关键词 圆斑星鲽  MHC  ⅡB  cDNA  基因结构  多态性  组织特性表达 

文摘内容 通过表达序列标签法和cDNA末端快速扩增(RACE)技术,分离和克隆了圆斑星鲽(Verasper variegatus)主要组织相容性复合体(MHC)IIB的全长cDNA序列,该cDNA全长为1144bp,5＇UTR(untranslated region)为7bp,3＇UTR为450bp,开放阅读框(ORF)长度为687bp,可编码228个氨基酸,包含信号肽、抗原结合域(β1)、IGC区(β2)、跨膜区和胞质区5个结构域。同源分析表明,圆斑星鲽MHCIIB氨基酸序列与其他硬骨鱼具有49%～79%的同源性,与鼠、人、红原鸡和护士鲨的相似性较低,分别为34%、33%、31%和30%。圆斑星鲽MHC ⅡB基因含有5个内含子,与其他硬骨鱼不同,其β2结构域编码区内存在1个109bp的内含子。根据获得的MHC ⅡB基因组序列设计特异性引物,在10尾野生圆斑星鲽中扩增了包括完整内含子1和外显子2的长度约388bp的DNA片段,PCR产物直接测序后发现在270bp的抗原结合域中共有23个位点发生变异,密码子第1位和第2位的变异明显高于第3位。利用荧光定量PCR分析组织表达发现,MHCIIB基因在健康圆斑星鲽9种组织中均有表达,但表达量存在差异,肾的表达量最高,肌肉的表达量最低,肾、心、脾脏和鳃的表达量显著高于肝、皮肤、脑、血和肌肉。本研究旨在为MHC基因家族的遗传进化分析、结构与功能的解析提供基础,同时为圆斑星鲽的分子免疫学和标记辅助育种研究提供参考依据。