3种分子标记在分析茶树种质资源遗传多样性上的比较

编号 zgly0001566305

文献类型 期刊论文

文献题名 3种分子标记在分析茶树种质资源遗传多样性上的比较

作者 张羽  李佼  席彦军  李秀峰  徐凯明 

作者单位 陕西理工大学生物科学与工程学院  陕西省汉中市农业科学研究所  陕西省汉中市职业技术学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年04期

年份 2017 

分类号 S571.1 

关键词 茶树  EST-SSR  SRAP  SCOT  多样性 

文摘内容 本研究的目的是比较EST-SSR、SRAP和SCoT标记在茶树资源研究中的可应用性,为茶树分子标记的选择与优化提供依据。本研究用6份有代表性的茶树资源,从中筛选出扩增条带清晰、多态性高的EST-SSR标记40对、SRAP标记40对、SCoT标记38个,对50份茶树材料的遗传多样性进行分析,重点比较了这3种分子标记的多态性条带比率（PPB）、多态性信息含量（PIC）、位点平均信息量(Ibav)、有效多元比率（EMR）、引物解析强度（Rp）、标记指数（MI）等方面的差异。40对EST-SSR引物共检测到320个等位位点,平均为8.00个,引物PPB、PIC、EMR、Ibav、Rp、MI值分别为94.06%、0.85、7.53、0.56、4.48、4.22。40对SRAP引物共检测到336个等位位点,平均为8.40个,引物PPB、PIC、EMR、Ibav、Rp、MI值分别为89.88%、0.77、7.55、0.61、5.11、4.61。38个SCoT引物共检测到439个等位位点,平均为11.55个,引物PPB、PIC、EMR、Ibav、Rp、MI值分别为90.66%、0.79、10.47、0.58、6.71、6.07。3种标记体系检测到的平均等位位点、EMR、Rp和MI值都表现为SCoT最高,其次为SRAP,再次为EST-SSR,而EST-SSR的PPB和PIC值最高,其次为SCoT,再次为SRAP。SCoT具有较高的标记效率,而EST-SSR标记具有丰富的位点多态信息。