巴西橡胶树6个小G蛋白基因cDNA的克隆与序列分析

编号 zgly0000626317

文献类型 期刊论文

文献题名 巴西橡胶树6个小G蛋白基因cDNA的克隆与序列分析

学科分类 220.5570;林产化学加工学

作者 石峰  秦云霞  唐朝荣 

作者单位 中国热带农业科学院橡胶研究所  海南大学农学院 

母体文献 热带作物学报 

年卷期 2009(3)

年份 2009 

分类号 S794.1 

关键词 巴西橡胶树  小G蛋白  全长cDNA  进化树  胶乳 

文摘内容 利用笔者实验室建立的橡胶树胶乳EST序列数据库,结合RT-PCR和RACE技术,克隆巴西橡胶树6个小G蛋白基因的cDNA,并以拟南芥小G蛋白家族基因为模板进行进化树分析。结果表明:所克隆的基因分属于小G蛋白的Arf与Rab家族,将其分别命名为HbArf1、HbArf2、HbRab1、HbRab2、HbRab3和HbRab4。氨基酸序列分析发现,HbRab1、HbRab2、HbRab3和HbRab4均具有小G蛋白家族的保守结构域,即4个鸟苷酸(GTP/GDP)结合域、1个效应区和C端半胱氨酸结构域,而HbArf1和HbArf2除在C端无半胱氨酸结构域及效应区序列保守性差外,HbArf1还缺少2个鸟苷酸结合区,HbArf2缺少1个鸟苷酸结合区。