基于454 GS FLX高通量测序的四川山鹧鸪基因组微卫星特征分析

编号 zgly0000976722

文献类型 期刊论文

文献题名 基于454 GS FLX高通量测序的四川山鹧鸪基因组微卫星特征分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 黄杰  周瑜  刘与之  朱丹  宋旭颢  陈本平  张修月  岳碧松 

作者单位 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室  四川大学生命科学学院  四川老君山国家级自然保护区管理局 

母体文献 四川动物 

年卷期 2015(1)

页码 8-14

年份 2015 

关键词 四川山鹧鸪  基因组序列  微卫星  分布 

文摘内容 为了有效地保护四川山鹧鸪Arborophila rufipectus这一中国特有珍稀濒危鸟类,本研究采用454 GS FLX对该物种基因组测序,首次利用微卫星搜索软件搜索并初步统计和分析基因组微卫星序列,共搜索到l~6个碱基重复类型的完美型微卫星335 263个。不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为197 913个,约占总数的59.03%,其次是四碱基、三碱基、六碱基、二碱基和五碱基,分别约占微卫星总数的13.59%、8.39%、7.55%、6.49%和4.95%。