一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法

申请号 CN202111386710.9

专利名称 一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法

专利类型 发明 

年份 2022 

公开号 CN114107443A

公开日 2022.03.01

主分类号 C12Q1/6809

分类号 C12Q1/6809 

申请日 2021.11.22

申请人 河南农业大学 

国家省市 河南 

联系地址 450002 河南省郑州市文化路95号

发明人 范国强  翟晓巧  王哲 

代理人 崔自京

代理机构 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465

优先权 CN202111386710(A) 20211122

内容摘要 本发明公开了一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法，属于分子生物学领域；包括下述步骤：(1)提取泡桐总RNA；(2)m6A测序：利用泡桐总RNA构建m6A文库，进行测序；(3)转录组测序：利用泡桐总RNA构建转录组文库，进行测序；(4)生物信息学分析：对m6A测序结果进行Peak分析，绘制出白花泡桐m6A修饰图谱，并基于Peak分析结果进行m6Amotif预测；对转录组测序结果进行转录组分析；进行m6A与转录组的关联分析，筛选出泡桐丛枝病相关基因。通过本发明方法进行泡桐丛枝病相关基因的分析筛选，为进一步探究泡桐丛枝病的发病机理提供研究思路并打下基础，有助于泡桐丛枝病的防治研究。

主权利要求 1.一种基于m6A甲基化测序研究泡桐丛枝病的方法，其特征在于，包括下述步骤：(1)提取泡桐总RNA分别提取泡桐丛枝病样本与健康样本，提取泡桐总RNA，进行总RNA样品检测；(2)m6A测序利用泡桐总RNA构建m6A文库，进行测序；(3)转录组测序利用泡桐总RNA构建转录组文库，进行测序；(4)生物信息学分析对m6A测序结果进行Peak分析，绘制出白花泡桐m6A修饰图谱，并基于Peak分析结果进行m6Amotif预测；对转录组测序结果进行转录组分析；进行m6A与转录组的关联分析，筛选出泡桐丛枝病相关基因。

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